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文献解读:基于mCRC基因组图谱的临床异质性

临床医学

1970-01-01      

1944 0
作者:张小顾
来源:TumorTalk

转移性结直肠癌(mCRC)是一个很大的公共健康问题:它是世界范围内引起癌症死亡的第三大原因,并且在年轻患者中的发病率也呈现上升状态。 然而,mCRC可以表现出从可治愈的寡转移状态(是一段肿瘤生物侵袭性较温和的时期,存在于局限性原发灶与广泛性转移之间的过渡阶段)到迅速发展的致命性病变一系列的临床表现,为何会有如此不同的临床表现?今年1月份发表在Cancer Cell上的一篇文章【1】定义了转移性肿瘤的基因组谱,并为基于潜在遗传性基础的mCRC临床异质性表现提供了证据,下面我们来看一下文章具体内容。

文章采用基于二代测序平台的MSK-IMPACT技术对1134个CRC标本的基因突变、DNA拷贝数变化、基因融合、整体突变负荷、MSI状态进行了评估,结果如下:

  • 1134个样本被分为3个亚组:POLE组、MSI-H组、MSS组,从下图可以看出90.6%(1027/1134)的CRC为MSS亚组。1.jpg

  • 为了确定导致肿瘤的等位基因,作者定义了MSS亚组的突变基因,发现了47个突变基因,包括常见的KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF、APC、TP53以及之前未见过的PTPRS、 PIK3CG、 FLT4、 MAP2K4、IKZF1、 JUN、TBX3、FOXP1、 INHBA、CDKN1B等基因,具体如下图所示:2.jpg

  • 研究发现85% 的MSS mCRC患者具有影响WNT 信号通路的突变, 包括一些新的突变类型:比如APC中与外显子9相邻的复发性内含子突变 和 CTNNB1(β-catenin)基因跨越3号外显子的框内缺失突变。

1.APC中与外显子9相邻的复发性内含子突变,引入了剪接受体位点,这导致蛋白质中的移码,APC蛋白的作用是增强降解复合体与β-catenin的亲和力,因此APC的改变可使β-连环蛋白避免降解,以此激活WNT通路。3.jpg2.β-连环蛋白(CTNNB1)的框内缺失突变破坏了促使β-连环蛋白降解的磷酸位点,防止β-连环蛋白降解,以此激活WNT通路。

4.jpg

  • 文章也研究了左右半结肠癌的特征:

1.右半结肠癌5年生存率显著低于左半结肠癌的5年生存率(45% versus 67%; P < 0.001);且右半结肠的突变负荷显著高于左半结肠 (7.15 versus 5.92 mutations per Mb; P < 0.001)。

5.jpg

2.左半结肠肝转移率和肺转移率更高,右半结肠腹膜转移和卵巢子宫转移率更高;(研究显示BRAF突变与腹膜疾病增加有关,KRAS突变与卵巢转移增加有关【2】,下图星号代表显著差异,P<0.05)。6.jpg

    3.右半结肠具有丰富的致癌基因突变:KRAS, BRAF, PIK3CA, PTEN, AKT1 ,左半结肠常见突变为TP53 和APC 。7.jpg

    4.来源于胚胎后肠的左半结肠相比来源于胚胎中肠的右半结肠具有更适度的突变负荷和更简单的组织学。

    5.左半结肠的突变主要存在于RTK(受体酪氨酸激酶)途径,右半结肠的突变主要存在于有丝分裂途径。这解释了为什么相对于右半结肠,左半结肠更能从抗EGFR靶向治疗(西妥昔单抗和帕尼单抗)中获益,并且提示其他RTK的选择性抑制剂如ERBB2可能在左侧肿瘤中表现出更高的功效。

    总之,此研究在临床背景下进一步明确了CRC的基因组改变情况,揭示了mCRC患者潜在的改变频率,并为原发肿瘤部位所见的临床差异提供了合理的生物学解释。

    参考文献

    1、Yaeger R,et al.,Clinical Sequencing Defines the Genomic Landscape of Metastatic Colorectal Cancer.Cancer Cell. 2018 Jan 8;33(1):125-136.e3.

    2、Yaeger, R., Cercek, A., Chou, J.F., Sylvester, B.E., Kemeny, N.E., Hechtman, J.F., Ladanyi, M., Rosen, N., Weiser, M.R., Capanu, M., et al. (2014). BRAF mutation predicts for poor outcomes after metastasectomy in patients with metastatic colorectal cancer. Cancer 120, 2316–2324.



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