约3.4%–3.8%非小细胞肺癌会发生脑膜转移，而其更常见于EGFR突变的患者，占9.4%。EGFR靶向治疗显著延长患者的生存期，但脑膜转移仍然十分棘手。由于脑膜病灶难以获取，对脑膜转移耐药机制知之甚少，越来越多的关注去探索是否可以代而使用液体活检即血浆和脑脊液，来追踪肿瘤的基因进化，从而阐明脑膜转移的机制。

血浆cfDNA已广泛用于液体活检，但它无法代表来源于颅内病灶的cfDNA，而脑脊液在在既往报道中有望成为CNS转移液体活检的重要途径。但目前在NSCLC，脑脊液在脑膜转移的液体活检的研究少，EGFR突变脑膜转移的耐药机制仍不清楚。

因此，本研究探讨脑脊液在EGFR突变非小细胞肺癌脑膜转移中作为液体活检介质的价值，及其肿瘤发展进化过程。

在EGFR阳性的非小细胞肺癌脑膜转移的患者中，脑脊液cfDNA的EGFR和原发灶一致，同时发现独特的基因谱，提示脑脊液cfDNA用于脑膜转移的液体活检的重要价值。

1、血脑屏障使得只有极少数的神经系统cfDNA释放到血浆中，故血浆cfDNA反应颅内病灶的价值有限；我们的研究进一步证实，脑脊液cfDNA更能反应颅内的基因谱。

2、血浆中肿瘤来源的cfDNA容易受背景cfDNA的干扰，而脑脊液中肿瘤来源的cfDNA含量高，不易受背景DNA的干扰。

3、与血浆cfDNA优于CTCs类似的道理，CSF cfDNA比脑脊液沉渣包含更全面丰富的基因信息。

4、脑脊液cfDNA可用于动态监测脑膜转移的肿瘤负荷。

染色体和基因水平上的不稳定导致CNVs（Copy number variations）的不断进化，本研究在脑脊液cfDNA中发现独特的CNVs，提示该CNVs可能是肿瘤进化的结果，甚至可能是脑膜转移的驱动主导因素。其中临床最密切相关的CNV是MET拷贝数增加，且在既往动物及细胞实验中， EGFR阳性的脑膜转移中MET拷贝数增加可导致对gefitinib耐药，且该耐药模型对EGFR-TKI和crizotinib联合治疗敏感，提示MET拷贝数增加可能是脑膜转移的一个耐药机制。总的来说，CNVs通过不同的基因轨迹影响不同通路的表达，进而产生具有选择优势的细胞群。所以本研究推测，在脑脊液cfDNA中发现的独特CNVs可能是肿瘤进化过程中出现脑膜转移的关键。

本研究在脑脊液cfDNA发现SCLC转化的分子特征：包括大量的TP53 LOH、RB1 、MYC和FGFR1变异。而既往报道中，SCLC转化的腺癌患者会保留腺癌特征的同时，也包含SCLC的某些分子特征。尽管本研究结果并未发现SCLC形态上的转化，但我们猜测，以上检测到的SCLC分子特征很可能是肿瘤进化的早期事件，需要进一步证实。

本研究在脑脊液cfDNA中发现T790M的突变率为30.4%，远远高于之前的报道。脑脊液T790M的检测可能与标本及检测手段有关，提示本研究中使用NGS和CSF cfDNA的优越性。