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新冠XBB.1.5传播呈现减退,验证了涟漪效应、也预示了疫情的未来趋势

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2023-02-02   

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用数据,来辨清事实。

关键词:COVID-19;Omicron;XBB.1.5

(不同新冠毒株的流行区域。图源:推特@MoritzGerstung

2023年1月21日,德国肿瘤研究中心(DKFZ)计算生物学家Moritz Gerstung在Twitter展示了新型冠状病毒(SARS-CoV-2)分子流行病学最新数据和评论【1】,显示目前在全球流行、并曾因为传染性更强而一度引起恐慌的新冠病毒Omciron子亚型XBB.1.5,传播呈现减退
这个结果再次验证了我之前对于新冠疫情波浪的涟漪效应猜想,也预示了疫情的未来趋势

(美国对流行毒株的监测报告。图源:美国CDC)


根据目前英国和美国的测序数据绘制的模型,XBB.1.5的growth rate(增长率)下降了0.02-0.04,这很显著,因为预测的及各国实测的XBB.1.5 growth rate在0.1上线浮动。而且这种传播趋势的缓解,快于预期的速度。
这点从美国CDC每周公布的突变株比例数据可以感受到。

Gerstung指出,Alpha和Delta的增长率相对稳定。但是Omicron流行开始,
Omicron的增长率在一定时间后会显著下降。这一方面是由于Omicron的generation time(传代时间)较短,另一方面是由于Omicron在起初迅速在人群中传播,造成了大量感染后,迅速建立群体免疫屏障

Nature Med建模的北京BF.7传播可以验证这一点

中国2022年新冠首篇重要论文来了!港大发表北京疫情流行病学建模文章,预计本月底感染率达92.3%

这里有个数据很有意思,就是Gerstung展示了Omicron各个亚型的预测growth rate和实际growth rate。


最早流行的BA.1和BA.2的预测值和实际值接近,而且都达到了0.2这个高值。BA.5和BQ.1.1则具有较低预测值和较高实测值。BF.7和XBB.1.5的预测值和实际值接近,而且都不高,其中BF.7始终低于1,这可能是BF.7始终没有广泛传播的一个原因。而XBB.1.5在美国也只是在东北部传播,而没有蔓延到全国
这就凸显了一个有意思的问题,为什么一个国家不同地区会同时流行两种或以上的亚型
Gerstung给出了解释,一个解释是这些亚型本身就是“趋同进化”的结果,他们本身之间差异不大,感染后具有交叉免疫,所以一种亚型不能把其他亚型完全取代。
更重要的是,每种亚型似乎找到了自己的最适人群,比如BF.7在北京,XBB.1.5在美国东北部。这可能是由多重因素决定的。

(涟漪效应。由中心开始蔓延出去波纹的波峰逐渐降低)

在BQ.1.1流行时我们介绍Eric Topol的解读,给出了其保持乐观的理由:
1)在先前感染、疫苗接种、二价疫苗及其组合的压力下,新毒株很难找到新宿主;
2)新毒株仍处于趋同进化中


由此,我们指出:Omicron群体免疫屏障建立后,疫情就像涟漪一样,疫情高峰一波弱于一波
这个特点在人群被Omicron大规模感染后的群体中反复出现,也被XBB.1.5所验证。
在今后全球普遍具有免疫屏障的情况下,SARS-CoV-2的疫情可能会逐渐像流感疫情一样,变成一种endemic

(科学必将获胜!)

参考文献:
【1】 https://twitter.com/MoritzGerstung/status/1616747471455260673

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