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第一次投稿 SCI 论文,有哪些要注意的地方?

临床研究

2021-09-07      

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英语写作是发表SCI论文必须过的一关,因为国内的中文期刊一般最多EI收录,想发表SCI论文很难。多读一些科技论文写作技巧的书是很有必要的,我当时读过《How to Write & Publish a Scientific Paper》和《How to Publish a Paper in the Top Journal》,这两本书都写得非常好,建议写英文论文有困难的科研er一读。

不知道题主什么专业,本人在生物医学等领域潜(hun)心(ri)钻(zi)研,以下就这一领域的SCI论文发表进行回答。(可能专业不同,但SCI论文写作的很多方面都是共通的。)

目录:

一、标题

二、摘要

三、图片

四、参考文献

五、选刊投稿

六、投稿后:对待审稿修稿意见就该全盘接收?

一、标题

标题党无所不在,不准确、不恰当的标题审稿人一看便没了兴趣,第一印象大打折扣。好的标题有四大关键ABCD:accuracy (准确)、brevity (简洁)、clarity (清楚)、draw (吸引)。

1.准确

一般而言,研究论文的标题应包含关键词描述结果,尽量避免使用非定量的、含义不明的词。常见的错误是论文标题太大或太小,论文标题表达不准确。

举例:标题“Transportation of corneal stem cells cuitured on amniotic membrane for corneal burn: experimental and clinical study”太大。该论文主要研究了corneal stem cells的体外培养和体内对兔角膜灼烧的影响。因此,写成experimental and clinical study是不恰当的。用“in vitro and in vivo”来替代"experimental and clinical study"更合适。

2.简洁

标题应以最少的文字概括尽可能多的内容,删弃多余的词语。至于字数,并无硬性规定,一般一篇论文标题不要超出100个英文字符,包括空格、标点。

举例:标题“Identification of human brain tumor initiating cells”,该论文题目特别醒目,一看就知道了他们发现了脑肿瘤干细胞,因此该论文具有突破性意义。如果将论文的标题改为 “CD+133 brain tumor fraction contains cells that are capable of tumor initiation in non-obese diabetic severe combined immunodeficient mouse brains ”就显得太长,而且不够醒目。

3.清楚

但也不能因一味追求“精选”字数而影响标题对论文内容的恰当反映。若不能两全时,先求表达明确。若简短标题不足以显示论文内容或反映属于系列研究的性质,或在内容层次很多的情况下,最好采用主、副标题相结合的方法,来补充说明特定的实验材料、方法及内容等信息,使标题既充实准确又不流于笼统和一般化。尽可能地将表达核心内容的主题词放在标题的开头。

举例:标题“Experimental study on mechanism and rarity of metastases in skeletal muscle",这个标题就没有把研究的对象、问题和结果说清楚。

4.吸引

标题应具吸引力,即要一目了然,所用词句及其所表现的内容不同,会产生截然不同的效果。好的标题能把作者的论文在同类研究中突出出来,既概括了全文,又引人注目。

二、摘要

摘要部分同样是文章的精华部分,不同于题目要根据实验发现具体问题具体分析,摘要部分的写法是有套路和模板的,也就是【1+1+n+1+1】的写作套路:

1.一句简要的背景介绍(研究的疾病的大背景或者特定分子在某种疾病中的作用等):ER-negative breast cancer are aggressive and associated with ….//xxprotein was shown to be lost in xxx cancer cells;

2.一句进行本研究的原因(这一疾病中的哪些方面还没有研究清楚等):extensive studies have focused on the identification of this tumor.//However, xxx were not fully understood;

3.n句总结实验结果:以Here, we sought to identify//In this study, we done xxx开始。描述几个主要结果,n = 3-5句话;

4.一句总结结论:Our studies demonstrate that ….. //Taken together,we identify …...总结结论时态要用一般现在时;

5.一句强调研究意义:Together, our data support targeting xxx as a potential therapeuticstrategy for xxx disease 临床意义永远是最好的研究意义,不过吹牛不要吹过头,如果实在和治疗扯不上边,可以写我们的工作对后续研究有怎样的贡献等.

三、图片

某些领域中,图片占有较大比重,没有图片的佐证任何论点都无法在文章中让人信服。

统计图(大多可用Excel)

包括柱状图,散点图、线图、生存曲线、流式图等,期刊对此类Figure要求最严,每种类型的统计图都有非常多需要注意的细节。

这张就是典型的柱状图,各种元素也很齐全。

图片要点

编号:如果是有多张图片拼合在一起的话,每张图片要用字母A、B、C、D来进行编号。每张编号的图片都要有相应的图注说明。

标题:多张图片在一起时,除了编号之外,最好还能有个标题。这样比编号更直观,让读者不看图注也能大概明白图片内容。

纵轴:多是数值,要注意有时候必须注明单位。

横轴:内容是分组情况时应写清组名,内容是数字,比如时间时,要注明单位。

误差线:表示标准差或标准误。

显著性符号:要在图注中说明各种符号所表示的含义,一般来说*/**/***分别代表P<0.05/P<0.01/P<0.001。除*外,常用的还有#、△等。

 

散点图


线图

 

生存曲线(可用Graphpad制作)

 

流式图(可用FlowJo制作) 

照片

照片也是一种常用的图片类型,能够对现实如实的反应,在临床研究中使用的更多。


图片要点

  • 照片背景应选用与其反差较大的颜色,突出边缘。下方应放置米尺,做标尺用,来说明大小。

  • 照片应遵照真实性原则,可以适当调整整体亮度、对比度等,但不能对局部进行PS调整。同时,可以用箭头指示病变部位。

X-ray、CT、PET-CT、MRI等造影照片是照片的另一大种类。此类照片最好保留电子版图片。如果只有胶片资料,则应尽量使用专业扫描仪提取电子相片。若条件不允许,也应摆正角度,用高分辨率的数码相机记录。

切片染色图


作为很多疾病诊断的金标准,使得染色图成为了很多论文中的支持结论的重要依据。染色图通过不同的化学试剂+抗体的组合,可以定性反映微观结构的改变,蛋白表达的分布等等。

图片要点

做染色图的时候要说明比例尺,比例尺能够说明微观结构的尺寸及放大倍数,是重要参数。上图中虽然没有画出来,但在图注里有这么一句说明:(C) IHC analysis of ZFX protein expression in human clinical samples of normal tissues, atrophy, intestinal metaplasia, dysplasia and GC tissues (n = 30, respectively), original magnification: X 200.

还要注意三个“度”。拍照时,注意调节曝光度,曝光度过低会让画面整体灰暗,曝光过度则可能损失图片重要细节,且后期很难用软件矫正。调节饱和度,饱和度代表画面的“鲜艳”程度。调节平衡度,尽量保证空白区域为纯白色,未矫正白平衡的照片会整体偏蓝或偏黄。

荧光染色图


非常漂亮的一种图,通常会展示同一视野下多种分子的表达情况,并在最后展示合并(Merge)后的图片,可用Image J制作。此类图片要注意标记每种颜色代表的分子,除上图的标记方法外,也可以使用下图这种直观的彩色标记。

条带图

以Western Blot最为多见,还有半定量PCR、SDS page、免疫共沉淀等。条带图上的重要的信息包括:条带代表的分子名称、条带分子量以及分组情况。


图片要点

条带左侧标记了分子名称;上方用划横线的方式将若干条带分组;也可以在右侧标记了蛋白分子大小(建议标注单位kDa)。

将不同条带裁剪组合在一张图上时,要注意保留条带上下一定的空白区域,如有杂带也应如实保留,否则可能遭到质疑。可以在不损失细节的情况下调整条带整体的亮度、对比度,但绝不能对条带局部进行调整甚至涂改,也不能从中间挖去某个条带。

也不能出现一图多用的情况,尤其注意不要重复使用同一张内参的条带图,也不要对条带进行简单的水平或垂直翻转就再次使用,一般editor和reviewer对这一点非常敏感,涉及科研诚信,不能马虎。

示意图

用于表达肉眼无法观察到的事物,或者抽象的概念,要求直观明确。

细胞作用示意图(可用PPT制作)

四、参考文献

参考文献是论文的最后一部分,也是好多论文的最差的一部分。

不少期刊的编辑一般通过参考文献找审稿人,所以引用一些近几年的文献可以给编辑提供方便,加快自己论文的发表速度。关键的参考文献一定要引用,在引言中对参考文献的评述一定要中肯、恰当,不然会被评阅人认为不了解研究背景,因此把你的论文毙掉。

使用恰当的文献管理工具,能让规范引文格式,大大提高效率。

参考文献也不是越多越好,太多参考文献可以理解为相关研究比较热,同时也可理解为你的文章可有可无。

五、选刊投稿

要选哪家期刊?老板和同组的大伙伴们都是很好的资源,因为你的研究方向肯定和他们有联系,请他们给你推荐合适的期刊。如果一定要你自力更生,那不妨反把他们发过的文章研究一下,他的哪种类型文章都投过哪些杂志,模仿起来。

如果你自己就是开山祖师……就从平时读过的文献里找吧。不过可能性太小,不多说。

从文章去找期刊有一个好处,因为每家期刊的宗旨、接收文章的类型都各有特色,要是直接找期刊的话你还要先了解各刊的胃口,对于只想发一篇文章的新手来说没什么卵用;倒追的话,这期刊都发过的类似的文章了肯定我这篇也在接收范围里。

还有一个小问题,新手往往不太自信,选择偏低分的期刊,于是就容易掉坑里。其实可以往高分的试试,万一被接收了呢?就算被拒,也许还能收到很有价值的意见。如果非要投不太主流的杂志,万一人家被踢出SCI了岂不是白发?(可以用Thomson Reuters网站下的Master Journal List工具来查询SCI是否收录该期刊)

目标刊物选定,就开始投稿吧。首先要给编辑写一封简洁有力又动人的cover letter,随稿件及其他补充材料一起上传到杂志网站的投稿系统。

Cover letter中比较重要的部分是审稿人的推荐,一般推荐3-4位,可以是国外研究方向与你相近的作者;或你文中引用的论文的作者;或自己熟悉的同专业的教授、副教授;再有就是在国际上有些影响的国内学者。如果你觉得有人跟你有利益冲突,不利于你文章发表,那么记得列个排除审稿人名单并说明理由,一般不超过3名。

接下来如果顺利,文章就进入同行评审,大概要等2-3个月才会有评审意见。这段时间可以稍作放松,但也别光用来吃喝玩睡,建议仍抽空继续关注文章相关领域,包括最新进展、既往文献中有没有当时被你漏掉的研究,再想想自己的实验,等审稿意见下来你要回复时,说不定会用到这些信息,有备无患。

六、投稿后:对待审稿修稿意见就该全盘接收?

首先,我们应该尊重审稿人,可以毫不夸张地说,在你的文章出版之前,甚至出版之后,没有几个人会像审稿人那样仔细体会和分析你的文章。

因此,我们应该充满感激、也认真思考和领会他们所提出的每一条意见,甚至是近乎苛刻的意见,但也不卑不亢。对于审稿人提出的意见,切忌“硬碰硬”,回复技巧很重要。

技巧1:先礼后兵,礼貌开头

Thank you for your letter and for the reviewers’ comments concerning our manuscript entitled “文章题目”. These comments are all valuable and very helpful for revising and improving our paper, as well as the important guiding significance to our researches. We have studied comments carefully and have made corrections which we hope meet with approval. (你的提议太有用了,我论文的质量蹭蹭蹭就上去了!我们相当仔细研究了你的建议之类的话)The responds to the reviewer’s comments are as follows: .......

技巧2:细节修改,不容小觑,一一作答,有礼有节

比如审稿人提出:图中需要补充比例尺

回复:As for the referee’s concern, we have added scale bars to the Figures.

比如审稿人提出:部分图片没有显著性差异

回复:As for the referee’s concern, we have indicated a significant difference with asterisk in figures.

比如审稿人提出:通篇语言问题不过关

回复:We are very sorry for the mistakes in this manuscript and inconvenience they caused in your reading. The manuscript has been thoroughly revised and edited by a native speaker, so we hope it can meet the journal’s standard. Thanks so much for your useful comments.

比如审稿人提出:补充缩写词的全称

回复:As for the referee’s concern, the full descriptions of the abbreviations like IHC, MTT etc have been supplemented in the revised manuscript.

比如审稿人提出:裂解液成分有问题

回复:We are very sorry for the mistake. Lentivirus-transduced cells were washed twice with PBS, and suspended in a lysis buffer (2% mercaptoethanol, 20% glycerol, and 4% SDS, in 100 mM Tris-HCl buffer, pH 6.8). The information for the lysis buffer has been corrected in the materials and methods.

技巧3:补充实验,耗时耗力,如果不补,只能argue

比如审稿人提出:补充正常皮肤细胞作对照

Tips:如果你真的不想补,或者正常细胞株,你也买不到,还是查一查正常细胞株的名字,告诉审稿人你确实是去努力过,只是事与愿违啊!

回复:Indeed, it will be more convincing if we get a comparative assessment on normal keratinocytes. However, the normal skin cell line TE 353.SK that we recently obtained could not be cultured stably under the condition of our lab at this time. We are also collecting human tissue samples from patients with primary melanoma and benign nevi. Based on our data, XXX expression will be analyzed in clinical samples by immunohistochemistry, and the correlation between XXX expression and the prognosis of melanoma will be determined in our subsequent investigations. Therefore, the referee’s concern is of importance for our further study, and we will show the results in our next paper for XXX.

比如审稿人提出:补充体内实验

Tips:补充动物实验,是审稿人最爱发的一招,其实一点不令人意外。既然躲不过,就要见招拆招,如果能补上,当然是给了漂亮的回马枪;要是没有条件补,或者实验来不及,也要尽量说的委婉点,假装你确实努力了,是审稿人给的时间太短了,我根本来不及啊!

回复:We are appreciative of the reviewer’s suggestion. Indeed, it will be more profound if we get the relevant results in vivo. We have purchased 10 thymus-null BALB/c nude mice (female, age 4-6 weeks) from the Animal Center of Chinese Academy of Medical Sciences. Osteosarcoma xenografts were established in nude mice according to a previous report (Gao et al., 2009) (我们去买了若干只小鼠,按照文献的方法操作). Briefly, control lentivirus or XXX gene shRNA-expressing lentivirus infected XXX cells (1×105) were suspended in 0.1 ml PBS and then injected subcutaneously into the proximal tibia of each anesthetized nude mice (n=5 in each group). Unfortunately, the xenografts could not grow after inoculation for three weeks (满怀欣喜的接种到动物身上,然而实验这东西,哪能一遍就成呢,我们做了一遍,结果没能成瘤,实在是悲剧了). The limitation of technical condition may be the main reason. Also, we doubt that the cell viability could be insufficient to initiate osteosarcoma tumorigenesis in vivo due to the long-distance transport. Therefore, we seek for the editor’s tolerance and understanding. Many thanks for your kind help!

然而,补充实验,还是逃不过的一劫,究竟是申请延期,再老老实实把实验做完,还是想投机取巧,argue一下,就看自己的运气了。一般情况,可以对照审稿人的意见综合权衡。高分文章,最好还是该补的全补了,低分文章,如果你觉得有80%的把握,完全可以凭你的劲爆人品成功拿下审稿人。



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百度浏览   来源 : 知乎 作者 酸菜   


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